Perangkat lunak untuk Mikrobiologi

Selain mikroskop dan cawan Petri, komputer adalah alat penting bagi ahli mikrobiologi. Perangkat lunak untuk penelitian mikrobiologi meliputi alat yang digunakan oleh disiplin ilmu dan teknik lainnya serta aplikasi khusus untuk studi bakteri dan mikroorganisme lainnya. Banyak aplikasi yang dikembangkan oleh lembaga pemerintah, yayasan nirlaba, atau peneliti akademis tersedia sebagai perangkat lunak gratis untuk diunduh dan digunakan sesuai eksperimen atau laboratorium Anda.

Alat Visualisasi
Gambar fisik atau mental dari data mentah yang Anda kumpulkan dapat membantu Anda lebih memahami kualitas, signifikansi, dan implikasinya. Perangkat lunak visualisasi data open source dan komersial tersedia secara luas untuk penelitian mikrobiologi. Buat bagan dan grafik data Anda menggunakan LibreOffice Calc, Microsoft Excel atau sistem visualisasi data Mondrian. Aplikasi Cell-O dan RasMol membantu Anda membuat model animasi 2D dan 3D dari molekul yang signifikan secara biologis seperti protein dan asam amino.

Pemodelan Matematika
Koleksi besar data mikrobiologi sering menghasilkan informasi yang lebih bermakna begitu mereka memiliki dianalisis secara numerik. Paket perangkat lunak MATLAB, Octave, dan SciPy yang melakukan penyempurnaan matematis, analisis, dan pemodelan data para ilmuwan. Gunakan paket-paket ini untuk melakukan estimasi parameter melalui pemasangan kurva, prediksi epidemiologis, simulasi pertumbuhan bakteri dan kebisingan data atau eliminasi efek stokastik. Aplikasi ini juga melakukan perhitungan statistik, seperti analisis varian atau uji Chi-square.

Genome Bioinformatika
Aplikasi perangkat lunak mikrobiologi juga membantu Anda memvisualisasikan dan menambang informasi dari urutan asam nukleat yang membentuk mikro- DNA organisme. Open Bioinformatics Foundation menyediakan aplikasi pengurutan dan analisis DNA sumber terbuka gratis seperti BioJava dan Biopython yang mengekstrak data dari bank informasi genom, mengurai kode DNA organisme dan membandingkannya dengan sampel DNA lainnya. Paket analisis genom tambahan termasuk Emboss, HMMER, Clustal Omega, Paket Inferensi Phylogeny, atau PHYLIP, dan Sequence Manipulation Suite, atau SMS.

Perangkat Lunak Referensi
Laju cepat penemuan ilmiah dalam mikrobiologi dan perubahan pemerintahan peraturan menjadikannya penting bahwa ahli mikrobiologi memiliki akses siap ke informasi yang berdampak pada pekerjaan mereka. HUGO adalah paket perangkat lunak komersial yang menyediakan informasi terkini tentang alat, bahan kimia, peralatan, media kultur, persyaratan keselamatan, organisme baru, perubahan taksonomi, dan antibiotik. Selain itu, ahli mikrobiologi yang bekerja dalam ilmu pangan dapat menggunakan aplikasi Web Browser ComBase untuk mengakses data mikrobiologis terkait makanan yang disediakan oleh lembaga pemerintah di Inggris, Australia dan Amerika Serikat.

URL:https://komputer.whycomputer.com/Internet/101308339.html